מכון אליה זוכה לשיתוף פעולה מלא עם רבנים גדולי תורה בהם הרה"ג גדעון בן משה שליט"א, הרב יאיר בן ישי שליט"א, הרב רפאל הכהן שליט"א מנהל מחלקת הכשרות בטבריה, הרב גבריאל מעודה שליט"א מנהל מחלקת הכשרות בבני עייש, הרב אברהם בן עמי שליט"א מנהל מחלקת הכשרות בקרית מלאכי ועוד רבים וטובים, אשר רואים במכון כגוף מוסמך המכשיר רבבות למקצועות קודש.
תוכניות הלימודים נבנו ביחד עם גדולי תורה ע"מ שהתלמידים יקבלו לידיהם את כל הכלים ואת כל האפשרויות ע"מ להשתלב במעגל העבודה. בקורס משגיחי כשרות, מועצת הרבנות הראשית היא זו שקבעה את התוכן והקורס בפיקוח של הרבנות הראשית לישראל
קורסים במכון אליה:
במכון אליה ניתן לקבל הכשרה במקצועות רבים כגון:
מכון אליה משתדל לסייע בהכוונה והשמה תוך כדי יצירת קשרים עם ראשי מועצות דתיות, מנהלי מחלקת כשרות ועוד. מכון אליה הפך עם השנים כמרכז לפניות עבור ארגוני הכשרות מהארץ ומחול כאשר כולם רואים במכון אליה כגוף אמין ואיתן בהכשרת משגיחי הכשרות
רבים מבוגרי המכון כבר פועלים בשוק העבודה ונמצאים בקשר רציף עם רבני המכון המספקים להם עדכונים רבים בתחום המקצועי